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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
20/12/2010 |
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Data da última atualização: |
19/01/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Valéria S. Mafra, APTA; Polyana Kelly. Martins, APTA; Marcelo Ribeiro-Alves, Fiocruz; Carolina S. Francisco, APTA; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF; Luciano T. Kishi, APTA; Marcelo A. Machado, APTA. |
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Título: |
Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
0058 PSO
Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010 |
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Conteúdo: |
Huanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, including oxygen binding, monooxygenase activity and oxidoreductase activity, 6 cellular components, mostly related to chloroplast, enriched at a statistically significant level of 0.001. MenosHuanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, includin... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Huanglongbing; Plant disease. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Fruta Cítrica. |
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Thesaurus Nal: |
Candidatus Liberibacter; Citrus. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
15/04/2024 |
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Data da última atualização: |
15/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
COELHO, M. C.; DAMASCENO, M. D.; MORENO, A. M.; DORNELES, E.; GUIMARÃES, A. S.; CARVALHO, B. C. de. |
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Afiliação: |
MILENA CARVALHO COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE JUIZ DE FORA; MARCILENE DANIEL DAMASCENO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; ANDREA MICKE MORENO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ELAINE DORNELES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; ALESSANDRO DE SA GUIMARAES, CNPGL; BRUNO CAMPOS DE CARVALHO, CNPGL. |
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Título: |
Avaliação da prevalência de endometrite citológica no pós-parto de vacas leiteiras alojadas em sistemas Compost barn (resultados preliminares). |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 28., 2023, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2024. |
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Páginas: |
p. 13-18. |
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Série: |
(Embrapa Gado de Leite. Eventos Técnicos & Científicos, 1). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Pibic/Fapemig. |
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Conteúdo: |
A doença uterina é importante causa de perdas reprodutiva e produtiva em vacas de leite. O diagnóstico e definição de casos são variados, mas a citologia endometrial é método confiável e sensível para a detecção de inflamações no endométrio de vacas no puerpério. O crescimento da adoção de sistemas Compost barn torna necessário caracterizar a saúde animal nesses sistemas, especialmente a prevalência de doenças uterinas. Objetivou-se avaliar a prevalência de endometrite citológica no pós-parto de vacas alojadas em sistemas Compost barn. Foram coletadas amostras endometriais pela técnica de Cytobrush em 117 vacas de um (01) a 45 dias pós-parto, em sete (07) fazendas, no Estado de MG e GO. As amostras foram coradas em laboratório pelo método de panóptico rápido e a contagem foi realizada em microscopia de imersão (1000X). Foram contadas pelo menos 200 células e calculada a porcentagem de neutrófilos polimorfonucleares e consideradas como positivas para endometrite citológica aquelas amostras com mais de 6% de neutrófilos. Dados de raça, ordem de parto e período pós-parto foram considerados e a prevalência de endometrite citológica calculada considerando o número de lâminas positivas em função do número total de lâminas com leitura. Os dados foram submetidos a análise de dispersão de frequência pelo teste exato de Fisher (P<0,05), considerando os efeitos de raça, ordem de parto e período pós-parto, utilizando o programa estatístico SAS, v.9.2. Das 117 lâminas, cinco (05) foram descartadas por baixa contagem ou ausência de células. A prevalência de endometrite citológica foi de 19,64% (22/112). Não foram observados efeitos de raça, ordem de parto ou de período pós-parto na prevalência de endometrite citologia. A continuidade do presente estudo, com aumento do número de animais avaliados contribuirá para a associação entre contagem de neutrófilos na citologia endometrial e a ocorrência de infecções uterinas em vacas leiteiras alojadas em sistemas Compost barn. MenosA doença uterina é importante causa de perdas reprodutiva e produtiva em vacas de leite. O diagnóstico e definição de casos são variados, mas a citologia endometrial é método confiável e sensível para a detecção de inflamações no endométrio de vacas no puerpério. O crescimento da adoção de sistemas Compost barn torna necessário caracterizar a saúde animal nesses sistemas, especialmente a prevalência de doenças uterinas. Objetivou-se avaliar a prevalência de endometrite citológica no pós-parto de vacas alojadas em sistemas Compost barn. Foram coletadas amostras endometriais pela técnica de Cytobrush em 117 vacas de um (01) a 45 dias pós-parto, em sete (07) fazendas, no Estado de MG e GO. As amostras foram coradas em laboratório pelo método de panóptico rápido e a contagem foi realizada em microscopia de imersão (1000X). Foram contadas pelo menos 200 células e calculada a porcentagem de neutrófilos polimorfonucleares e consideradas como positivas para endometrite citológica aquelas amostras com mais de 6% de neutrófilos. Dados de raça, ordem de parto e período pós-parto foram considerados e a prevalência de endometrite citológica calculada considerando o número de lâminas positivas em função do número total de lâminas com leitura. Os dados foram submetidos a análise de dispersão de frequência pelo teste exato de Fisher (P<0,05), considerando os efeitos de raça, ordem de parto e período pós-parto, utilizando o programa estatístico SAS, v.9.2. Das 117 lâminas, cinco (05) foram d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Período de transição. |
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Thesagro: |
Citologia; Gado Leiteiro; Metrite; Reprodução Animal; Saúde; Útero. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1163620/1/Avaliacao-da-prevalencia-de-endometrite-citologica-.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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